установка через манагер пакетов

Отключи левые репы, тогда не будет предупреждений. Снаптик тот же апт, только с гуем.

Для стандартных репозиториев такого быть не должно.
Для сторонних репов частенько нужно установить через apt-key соответствующий ключ. Иногда ключи бывают в виде пакетов в этом же самом стороннем репозитории.

Для стандартных репозиториев такого быть не должно.

Но будет если взломали сервак.

>насколько безопасно ставить программы используя synaptic?

смотря какой репозиторий

если он располагается на народе и предлагает установить ускоритель интернета...

а разве в дистрибутиве убунты могут затесаться левые репы? если сам ихне прописывал?

тогда вам, наверное, подсовывают левые пакеты. а вообще, вывод

cat /etc/apt/sources.list
ls -al /etc/apt/sources.list.d/

встудию.