При включенном компизе и правый и левый клики часто не срабатывают, если после клика немного не сместить курсор. (Левый клик глючит только там, где он вызывает какое-нибудь меню. Соответственно, правый глючит почти всегда, т.к. он, в основном, только меню и вызывает).
Особенно заметно на панели гнома, где часто приходится вызывать контекстное меню для разных апплетов.
gnome, arch.