Часто можно встретить desktop-файлы в которых строчка Exec= заканчивается %F , %a &etc. За время использования командной строки не припомню, что бы я лично как-то так заканчивал команду, н-р:
cat /usr/share/applications/gparted.desktop | grep Exec
Exec=xdg-su /usr/sbin/gparted %f