Прочитал ман, нашёл только 2 опции --replacefiles и --replacepkgs не то.
А хочется заставить его заменять новые пакеты старыми:
[root@sanya gordon01]# urpmi x11-server A requested package cannot be installed: x11-server-1.7.7-1mdv2010.1.i586 (in order to keep x11-server-1.9.4-3-mdv2011.0.i586) Continue installation anyway? (Y/n)