Linux виснет при загрузке графической оболочки

Подробней.

и надолго виснет? на некоторых конфигурациях при неправильно прописанной мыши х-сы могут пробовать ее найти до 5 минут - лично видел, при этом на клавиатуру практически не реагируют

можно попробовать что-то типа startx > x.log 2>&1 (или к startx добавить -probeonly) и посмотреть на чем он "затыкается"

runlevel ?