каждый раз при старте системы. Пробовал писать в /etc/rc.local и присваивать этому файлу флаг выполнения. Пробовал копировать /etc/init.d/skeleton, править его и запускать
update-rc.d xset defaults 99
Ни один из этих способов эффекта не дал. Энергосбережение экрана всё равно работает. Если же запустить команду вручную, то оно благополучно отключается. ЧЯДНТ?
xset обращается к X-серверу. На момент запуска скрипта X-сервер не запущен, да и переменная DISPLAY не установлена, так что даже к запущенному X-серверу невозможно подключиться.
Лучше добавьте эту команду в /etc/X11/xinit/xinitrc.