Сделал так:
Package: *
Pin: origin "notesalexp.net"
Pin-Priority: 1
Package: *
Pin: origin "/mnt/desktop/install/Mirrors/debian/squeeze/notesalexp"
Pin-Priority: 1
Получилось так:
root@aidaho-laptop:/home/aidaho# apt-cache policy screen
screen:
Установлен: 4.0.3-14
Кандидат: 4.1.0~git20110819-1
Таблица версий:
4.1.0~git20110819-1 0
500 file:/mnt/desktop/install/Mirrors/debian/squeeze/notesalexp/ squeeze/main i386 Packages
1 http://notesalexp.net/debian/squeeze/ squeeze/main i386 Packages
*** 4.0.3-14 0
500 file:/mnt/desktop/install/Mirrors/debian/squeeze/squeeze/ squeeze/main i386 Packages
500 http://ftp.debian.org/debian/ squeeze/main i386 Packages
100 /var/lib/dpkg/status
Холдить и пиннить отдельные пакеты руками не предлагать.