Fluxbox vs Blackdox

сорри Blackdox = Blackbox

Блэкбокс - это самый первый из боксов с которого все и начиналось. Все его темы подходят и к флуксбоксу. Во флуксе, особенно последних версиях, на порядок больше фишек. Взять хотябы новые табы (в блэкбоксе они ваще были?), pixmap темы и т.д.

Зайди на fluxbox.org, там написано:
It's based on the Blackbox 0.61.1 code.
Это просто форк, который получил дальнейшее развитие.