Был баш скрипт который генерировал документацию. Там происходит подмена переменной, поэтому doxygen вызывается с параметром ('-') чтобы читал из stdin.
( ( cat $DOXYFILE ; echo "OUTPUT_DIRECTORY=$RESULT_DOXYGEN_DIR/" ) | doxygen - ) >> $LOGFILE 2>&1
И этот код отлично работал. Встала задача переписать это под питончик. Да еще и направить stdout и stderr в файл
sys.stderr = open("/tmp/tmp_stder.log", "w+")
sys.stdout = open("/tmp/tmp_stdout.log", "w+")
errcode = subprocess.call(['doxygen','-'], stdin=file_doxy, stdout=sys.stdout, stderr=sys.stderr, shell=False)
print errcode
Не выводит ничего никуда. Может быть это баг в библиотеке subprocess?