После установки ядра 2.6.14-r5 (вместо 2.6.14-r4) мой PCI драйвер перестал реагировать на прерывания от DMA. Причем и прерывания стали определяться по-другому (раньше IRQ 10, сейчас IRQ 5). Что случилось ? Непонятно. Прерывания определяю так: pci_read_config_dword(....., &mirq) request_irq(mirq, irq_hndl, SA_SHIRQ, ..., dev_id);
Ну и еще, что в системе изменилось - поставил ext3 вместо ext2.