Немного играюсь с cython'ом. Решил написать небольшой враппер, скармливающий данные одной библиотеке, столкнулся с небольшой проблемой.
Код враппера:
# -*- coding: utf-8 -*-
#cython: wraparound=False
#cython: boundscheck=False
from cpython cimport array
import array
ctypedef public struct qmmmdata:
int atomNR
int* labels
cdef void gen_input_data(qmmmdata *data):
cdef int N = 5
cdef array.array labels = array.array('i', [6, 4, 6, 1, 1])
data.atomNR = N
data.labels = labels.data.as_ints
print 'Before'
print 'Atom N:', data.atomNR
print 'Labels:', [data.labels[i] for i in range(data.atomNR)]
cdef void print_result(qmmmdata *data):
print 'After'
print 'Atom N:', data.atomNR
print 'Labels:', [data.labels[i] for i in range(data.atomNR)]
cdef void do_work():
cdef qmmmdata data
gen_input_data(&data)
print_result(&data)
if __name__ == '__main__':
do_work()
И запускаю вот так:
$ rm -f test_array.c test_array.h test_array.exe
$ cython --embed test_array.pyx
$ gcc test_array.c -I/usr/include/python2.7 -L/usr/lib -lpython2.7 -o test_array.exe
$ ./test_array.exe
Before
Atom N: 5
Labels: [6, 4, 6, 1, 1]
After
Atom N: 5
Labels: [159730576, 4, 6, 1, 1]
Возможно ЛОР сможет подсказать причину изменения содержимого переменной data.labels? Если реализовать этот кусок иначе, например с numpy массивами и передачей указателей на них, то все ок. Но теперь интересует причина проблем в этом месте.
