перезапись core файла при повторном падении

Чему равен sysctl kernel.core_pattern? В общем, попробуй с ним поиграться.

$ sysctl kernel.core_pattern
kernel.core_pattern = |/usr/share/apport/apport %p %s %c %P

Ну дык настрой как надо :). man apport или вообще задай свой паттерн.

так проблема не в имени, меня устраивает имя core (ведь тут имя задается только)
но я хочу чтобы новое падение программы сделала новую корку, согласно новому падению

Тебе нужно а) посмотреть man core б) посмотреть man apport. В твоём случае затык, скорее всего, в apport потому что он управляет корками.

man core читал, но не мой случай
видимо мой случай тут https://bugs.launchpad.net/ubuntu/ source/apport/ bug/160999

Просто отключи apport если он тебе не нужен (имхо). По-моему, эта хрень опциональная и у меня на сервере (ubuntu 16.04) её нет. Либо напиши свой скрипт который будет складывать всё как тебе нужно, это несложно.

я не знаю нужен мне apport или нет (еще не разбирался, посмотрю)
мне нужно чтобы корка переписывалась новой взамен поверх её
жаль что не работает изначально

поправил /usr/share/apport/apport так (строка 172):

было:

    core_path = os.path.join(cwd, 'core')
    try:
        with open('/proc/sys/kernel/core_uses_pid') as f:
            if f.read().strip() != '0':
                core_path += '.' + str(pid)
        core_file = os.open(core_path, os.O_WRONLY | os.O_CREAT | os.O_EXCL, 0o600)
    except (OSError, IOError):
        return

    core_path = os.path.join(cwd, 'core')
    try:
        with open('/proc/sys/kernel/core_uses_pid') as f:
            if f.read().strip() != '0':
                core_path += '.' + str(pid)
    except (OSError, IOError):
        return
    try:
        os.unlink(core_path)
    except (OSError, IOError):
        pass
    try:
        core_file = os.open(core_path, os.O_WRONLY | os.O_CREAT | os.O_EXCL, 0o600)
    except (OSError, IOError):
        return

Достаточно было убрать os.O_EXCL.