С помощью pci_enable_msi и devm_request_irq удается заставить драйвер реагировать на прерывание с индексом 0 (MSI 0). Возникла необходимость добавить реакцию на MSI 1.
Чтение http://lxr.free-electrons.com/source/Documentation/PCI/MSI-HOWTO.txt достичь просветления не помогло. Тут я четко вижу что у struct pci_dev есть только одно поле unsigned int irq: http://lxr.free-electrons.com/source/include/linux/pci.h#L335
Может это не нужно явно прописывать и в обработчике можно в любой момент получить номер MSI?