как в css, выделять отдельные слова цветами для публикации цветных исходных кодов.

Каждое слово в span с нужным классом.

Ясно, это единственный способ?

Можно воспользоваться любой онлайн раскраской, которая сжуёт ваш код на си, а выплюнет вам html.

Если просто надо публиковать исходники, то vim2html.

Обычно это делается не вручную, а с помощью специальных программ и скриптов, которые это делают автоматически.