Я их копирую себе на диск

git clone

в отдельном бранче

git checkout -b new_branch

Делаю какие-то изменения

...

отдельный коммит

git add .
git commit -m «new_commit»

попали обратно в исходный репозиторий

git push --set-upstream origin new_branch

git push --set-upstream origin new_branch

Так это разные компьютеры будут, доступ пока только через rdp. Я git clone буду копировать к себе на комп. И хочу потом обратно отправить то же через rdp. Только не говорите, что я должен потом обратно весь clone каждый раз копировать.

Тогда лучше, вероятно, так сделать.
На удаленном компе:
git clone
git checkout -b new_branch
Скопировать себе содержимое каталога, внести изменения, залить обратно (перед заливкой убедиться, что на удаленном компе git checkout new_branch)
Ну и потом с удаленного как обычно:
git add .
git commit -m «new_commit»
git push --set-upstream origin new_branch

Только не говорите, что я должен потом обратно весь clone каждый раз копировать

Можно не весь, а только измененные файлы

Можно не весь, а только измененные файлы

Т.е. получается, на удаленном компе нужно держать копию, и туда патчами заливать изменения. И после git push --set-upstream origin new_branch.

Так это разные компьютеры будут, доступ пока только через rdp

Настроить доступ по ssh и по-человечески делать push/pull

git bundle?

норкомания

можно через git diff, git apply

Используй cherry-pick

это ответ на вопрос из заголовка. в самом описании, как я понял, совсем обычная рутинная задача - поправить код, но сохранить в отдельном бранче. все это в remote git.