Ищу аналог make, понимающий (дедуцирующий) зависимости из заданных коммандных строк в Makefile

Это - одна из причин создания ЯП D, а именно, возможность узнать зависимости между модулями. В C/C++ это весьма сложно, и главная причина этому - препроцессор, который может вытворять самые непредсказуемые трюки, потому приходится описывать правила сборки руками.

> потому приходится описывать правила сборки руками.

либо получать их у gcc автоматически, с помощью ключей -M :)

> либо получать их у gcc автоматически, с помощью ключей -M

Ключи -M дают список включаемых файлов (практически всегда это - файлы заголовков .h), а из них далеко не всегда можно получить список файлов исходных кодов, потому что препроцессор.
Да, можно следовать своим определенным правилам, позволяющим легко получать зависимости, но им нужно следовать.

> а из них далеко не всегда можно получить список файлов исходных кодов, потому что препроцессор.

хмм, почему ? -M это и есть препроцессор, в смысле что он там запускается при генерации зависимостей:

-M Instead of outputting the _result of preprocessing_, output a rule suitable for make describing the dependencies

если Вы про #ifdef PLATFORM1 так эти зависимости на другой платформе быть не обязаны и если у нас не PLATFORM1 то и учитывать их не надо, имхо.

автотулсы как раз используют -M если я не ошибаюсь.

Извиняюсь, что потревожил, это я туплю: мы говорим про разные вещи, потому что я плохо прочитал первый пост.

А вот более другие make вроде scons/cmake умеют сами определять зависимости (или их проще описать, см. однопроходный jam вместо многопроходного make)