Передача параметров из командной строки в запущенное приложение

Qt dbus ?

Можно просто через юникс-сокет или fifo.

Если "как у белых людей", то dbus. Если дёшево и сердито, то пишем данные в файл и шлём проге SIGUSR1.

Понятненько...

Ещё для GUI QT можно попробовать QtSingleApplication, правда там нужна коммерческая лицензия... по крайней мере пока

http://www.qtsoftware.com/products/appdev/add-on-products/catalog/4 (->Utilities->Single Application)

есть DSingleApplication