а возможно как-нибудь заставить doxygen генерировать графы вызовов функций по-требованию, без полной пересборки документации при изменении проекта ну и вообще доделывать документацию если что-то изменилось, а не пересобирать пол суток?
и желательно чтобы вся эта туча картинок не хранилась на винте а нужные генерились в тот момент когда на нее посмотреть хочешь.