Пакет cmap, видимо, не дружит с пакетом cyrtimes (русские таймсоподобные шрифты, есть в дебиане и в убунте). В итоге acrobat reader неверно копирует русский текст из pdf. С разными foxit/okular/evince проблем нет, но acrobat reader одинаково криво работает в виндоуз и в линукс.
Отключение пакета cyrtimes помогает в нижеследующем тестовом примере. Вопрос: как бы всё-таки исправить проблему, не отказываясь ни от cyrtimes (читаь удобнее, буквы толще), ни от ридера (стоит много где)?
\documentclass[a4paper,10pt]{article}
% это работает:
\usepackage{ucs}
\usepackage[utf8x]{inputenc}
\usepackage{cmap}
\usepackage[T1]{fontenc} %T2A или T1 -- не важно
\usepackage[english,russian]{babel}
\usepackage[unicode]{hyperref}
\usepackage{mathtext}
% а это ломает русский при копировании:
\usepackage{cyrtimes} % %(
\begin{document}
В Acrobat Reader этот текст нормально не копипастится.
\end{document}