"французский не знаю, но по-французски умею"

не знаю я питона, но с высот великого и могучего С могу сказать, что wait тупо ждет завершения процесса.

А зная аглицку мову, могу скаать, что communicate переводится как «общаться». И наверняка еще пожет принимать какой-то параметр (в питоне)

да, не знаю я питона... «The whole purpose of the communicate method is to wait for the process to finish and return all the output»...

На первый взгляд кажется, что ты нас обманываешь и вызываешь Popen с разными аргументами в случае communicate и wait.

Если только меня обманывает моя память.) Но раньше следующего рабочего дня её не проверить. Наверное, существенно также то, что код выполнялся под виндой.

Скорее всего ты и вправду где-то напортачил, communicate работает прекрасно:

>>> from subprocess import Popen, PIPE
>>> p = Popen('cat', stdin=PIPE, stdout=PIPE)
>>> stdout, stderr = p.communicate('Hello, World!')
>>> print stdout, stderr
Hello, World! None
>>> 
>>> p = Popen(['echo', 'test'], stdin=PIPE, stdout=PIPE)
>>> stdout, stderr = p.communicate()
>>> print stdout, stderr
test
None
>>> 

С простыми командами, конечно, работает. Необычное поведение я пока заметил только при вызове ssh одной строкой. Причём, если линь, заметив такой ввод без shell=True, сразу ругнётся, то винда съедает и при использовании wait() даже выполняет, чего, согласно документации, кажется, быть не должно.