Собрать алгоритмически точки на графике в линию

http://en.wikipedia.org/wiki/Simple_linear_regression

Метод наименьших квадратов?

Самое универсальное - метод наименьших квадратов. А предварительно можно было бы выделить кластеры точек (там на картинках есть кластеры точек, которые далеки от общей линии). Кластеры можно выделять диаграммами вороного, например. А уже внутри кластера строить регрессию. http://ru.wikipedia.org/wiki/Диаграмма_Вороного http://ru.wikipedia.org/wiki/Метод_наименьших_квадратов

http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-intro.html#Linear-models