как создать ярлык на скрипт .py?

А так

mkdir ~/.scripts
mv папка-где-скрипт/скрипт.py ~/.scripts
echo 'export PATH=$PATH:$HOME/.scripts' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc
скрипт.py

Ну и, конечно же, сделать исполняемым.

в каком формате это сделать? (.sh, .bin..)

в каком формате это сделать? (.sh, .bin..)

py

В .py И не забудь о первой строчке в скрипте

#!/usr/bin/env python