Главный критерий выбора, инструмент должен быть простым. То есть я не хочу связываться с cmake/autotools и подобными, проверка внешних зависимостей мне не нужна.
Собираю обычно мелкие проектики на C, и уже устал постоянно допиливать Makefile. Хочеться результат сборки положить в отдельную директорию, не так просто заставить make это делать. Разложить исходники по разным директориям, снова make сопротивляется. Ещё какие-то более мелкие проблемы (пересборка с новыми CFLAGS например).
Хотя подозреваю, что никакой подходящей замены не существует.
Добавка: впомнил про mk (p9port) и нашел aap, посмотрю.