gentoo обновление системы

Менялись флаги, обновлялись пакеты и к ним добавлялись новые зависимости.

Система базовая, практически ничего не ставилось. Мои флаги в make.conf: -qt4 bindist mmx sse sse2.

Почему он к примеру хочет установить links? Я его не ставил, а он его хочет установить с обновлением

emerge -avuDN world и смотри причины

Пакеты, входящие в stage скомпилированы с набором флагов, отличных от тех, что установлены в профиле.

Добавь флаг -t, будет видно кто кого тянет.

Смотри какой у тебя профиль, и какие флаги в нём включены по дефолту.

Ты же выбрал профиль, посмотри вывод:

emerge --info

Ну и по поводу выбранных флагов, bindist лучше выключить, включение этого флага отключит при сборке программ поддержку технологий, которые по тем или иным причинам подпадают под лицензионные ограничения.

Я выбрал профиль desktop :) Теперь ясно, спасибо всем.