Gentoo: кому принадлежит gprof?

 $ equery belongs /usr/i686-pc-linux-gnu/binutils-bin/2.16.1/gprof
[ Searching for file(s) /usr/i686-pc-linux-gnu/binutils-bin/2.16.1/gprof in *... ]
sys-devel/binutils-2.16.1 (/usr/i686-pc-linux-gnu/binutils-bin/2.16.1/gprof)

Посмотри, что такое `which gprof`:
/usr/bin/gprof -> /usr/bin/i686-pc-linux-gnu-gprof -> ../i686-pc-linux-gnu/bin/gprof -> /usr/i686-pc-linux-gnu/binutils-bin/2.16.1/gprof
$ equery belongs /usr/i686-pc-linux-gnu/binutils-bin/2.16.1/gprof
[ Searching for file(s) /usr/i686-pc-linux-gnu/binutils-bin/2.16.1/gprof in *... ]
sys-devel/binutils-2.16.1 (/usr/i686-pc-linux-gnu/binutils-bin/2.16.1/gprof)

Все промежуточные ссылки создает binutils-config в рантайме, поэтому они не принадлежат никому согласно equery.