Сбой в определении запущенных процессов в Linux

Вероятно, остался от предыдущего запуска файл-индикатор, обычно удаляемый приложением при остановке. Попробуй найти и удалить «руками»

В папке /run смотрел все pid, не нашел ничего об приложении,также через strace смотрел всё к чему стучится программа,были ошибки на невозможность создать файл из-за доступа и отсутствовали папки, эти ошибки исправил, куда копать дальше не представляю

/var/run, /var/log и прочее?

var/run смотрел, ничего не обнаружил, может конечно сам виноват, на чтобы вы в этих папках в-первую очередь обратили внимание? var/log сейчас проверяю,вопрос аналогичный, на чем концентрироваться в этой папке?

на чем концентрироваться

На том, что содержит в себе название твоей программы (в файле или в названии файла).

/var/run - проверил бы на наличие того, что не запущено в данный момент (по списку процессов).

strace

смотри также те файлы, которые успешно открылись, особенно те, которые открывались сразу перед выводом указанной ошибки

Ошибки показанные в текстовом файле созданном с помощью strace исправил, но проблема осталась

Перед запуском программы,запускается еще одни процесс,сейчас попробую его пропустить через strace