Есть ebuild, в котором есть строка
emake -j1 DESTDIR="${D}" install
Естественно, портаж удаляет все временные файлы сборки, путь к которым зашит в образ. Образ грузит библиотеки по этому пути (естественно, неудачно).
Можно как-то решить эту проблему средствами ebuild, чтобы зависимость видела пути без /var/../image/? Какая-нибудь фича портажа, которая делает чрут туда, например.
В dev-scheme/sheme48 готовится подобный образ, но там build-image.sh скрипт сложнее. А я в scheme пока не умею, чтобы фиксить такие проблемы.