squashfs довольно удобно использовать, если нужно быстро сделать копию старой системы. Оно умеет находить дубликаты при копировании и т.д. Порой использую sqfs для того, чтобы просто забекапить жесткий диск в один файл и оставить в долгий ящик для дальнейшего разбора - какие файлы оставить, какие удалить.
Нет случаем чего-то похожего на squashfs но с возможностью удалять файлы?
