Возможно ли у становить virtualbox в криптоконтенер TrueCrypt?

Ну и поставь ее на этот «отдельный диск», в чем вопрос-то? Либо можно поставить в дефолтный каталог, перенести в контейнер и сделать туда симлинк - тогда его можно будет быстро поменять если у TC изменится точка монтирования.

1.создаёшь файл-контейнер определённого размера vb.tc.
2.mkdir tempvb
3.монтируешь

truecrypt vb.tc tempvb

Принципиальной проблемы реализации я не вижу, но подозреваю, что могут быть проблемы с быстродействием. Но проверить это можно только опытным путём. Удачи.

Как это можно сделать?

Закусывать надо.