Вот такой minimal not working example:
\documentclass{article}
\begin{document}
<<setup, include=FALSE, cache=FALSE>>=
library(knitr)
library(kableExtra)
dt <- mtcars[1:5, 1:6]
kable(dt, "latex", caption = "Demo table", booktabs = T) %>%
kable_styling(latex_options = c("striped", "hold_position"))
@
\end{document}
Документ компилируется, ошибок никаких нет. В тексте PDF есть только надпись «concordance=TRUE» и номер страницы.
Текст взят из мануала к kableExtra. ЧЯДНТ?