автозагрузка приложения

Смотря, что за система. Например в Дженте: /etc/conf.d/local.start

Если там также как и SuSE 10, то смотри в /etc/init.d/skeleton. 
Это образец как запускать, останавливать процессы, смотря какое
приложение нужно запускать. Когда подредактируешь файл skeleton,
например сделать из него test для запуска процесса test1,
то делаешь так:
insserv test
Будет стартовать!
См. insserv --help

Насколько я знаю Suse, то /etc/rc.d/boot.local