Какой-то пакет при установке испортил perl и теперь он тычется в пустой каталог /usr/local в поисках программ и библиотек.
Поискал на форуме gentoo были похожие случаи, но их рецепт запустить perl-cleaner --all и perl-cleaner --reallyall не помогли.
Не помог и снос его и всех его библиотек через qlist -CI | xargs emerge -C.
При попытке собрать пакеты получаю:
Can't locate ExtUtils/MakeMaker.pm: /usr/local/lib64/perl5/5.30.2/x86_64-linux/ExtUtils/MakeMaker.pm: Permission denied at Makefile.PL line 2.
Откуда он его вообще взял?