Шалом.
Хост ESXi за километры, система на флешке, нужна копия на всякий случай. В системе есть dd. Если прямо из под системы скомандовать dd if=/dev/usbflash1 of=/dev/usbflash2, это будет работать?
Я вот не нашел причин, что бы не работало, но беглый поиск в интернете точку в вопросе не поставил.