Не работает 2 монитор в Fedora после установки драйвера на видеокарту.

А что за фирма-производитель 1650-ой, у которой VGA выход? По-моему их убрали уже все к выпуску 1650-х. Или ты один монитор вешаешь на встроенную, а второй на дискретную?

VGA подключен к материнской плате, а HDMI к видюхе

Запусти Driver Manager для начала, чтобы ты смог посмотреть, какие у тебя драйвера имеются. Можешь даже потыкать в разные варианты. И если ты ставил проприетарные драйвера nVidia, то можешь запустить менеджер nVidia и посмотреть, что там. Может быть сам сможешь разобраться. Но я кстати не знаю, как nVidia-settings будет отображать монитор со втроенной.

Ну и покажи вывод xrandr, конечно.

У тебя очень странная конфигурация, мне лично не понятно, зачем ты так делаешь. У тебя нет варианта подключить все мониторы по цифровому сигналу к дискретной видюхе? По HDMI или DisplayPort. VGA в 2021 году странно использовать.

Такой кейс возможен, только если в материнке есть поддержка одновременной работы igpu и дискретки. Что за мать?