После нажатия Ctrl+Alt+G всё равно работают кнопки из моего kde. То есть, при нажатии Win открывается меню как в основной системе, так и в запущенной через qemu. Вот команда:
qemu-system-x86_64 -hda ~/Qemu/manjaro.img -enable-kvm -show-cursor -soundhw ac97 -vga qxl -smp 4,sockets=1,cores=4,threads=1 -m 4374