нету установленных приложений в меню приложений gnome

Гном убожество, попробуй , не поможет выйди из сессии и перезайди

env XDG_MENU_PREFIX=gnome- gnome-panel --replace

gnome-shell –replace

Сейчас

update-desktop-database ~/.local/share/applications

https://wiki.archlinux.org/title/Desktop_entries
Пункт 3.5

Поройся на ЛОРе, эта тема поднималась где то в пределах года-полутора. Там вроде даже кто то что то подсказывать пытался.

А вообще удали этот хлам нафиг, лучше cinnamon или mate поставь.

Переместите всё из ~/.local/share/applications для начала — вероятно, вы что-то намудрили в редакторе меню. Если это исправит проблему, то можете начинать возвращать файлы обратно по одному, пока не найдёте тот, что вызвал проблемы.

Также можете попробовать сбросить расположение значков, сохранённое в dconf:

gsettings reset org.gnome.shell app-picker-layout