Даже если мы заняли 10% тома, а спрятанный криптоконтейнер лежит начиная от 50% тома, то есть шанс, что ФС может запороть его, записывая служебные данные в «свободное» место. А еще хотелось бы правдоподобно добавлять и изменять данные.
Например ext3/ext4 пишет резервные суперблоки далеко за пределы MFT, и это только суперблоки. NTFS вообще живет своей жизнью. ExFat стремится минимизировать повторное использование блоков, чтобы щадить флэш-накопители, вероятнее всего она делает это обильно разбрасывая данные по диску, как - хз.
И по факту остается только морально устаревшая FAT32, которая позволяет делать максимальный размер раздела в 1 ТБ.
Посоветуйте ФС, которую можно нафигачить на раздел в 4 ТБ, чтобы можно было первый 1 ГБ использовать как угодно, и при этом по логическим адресам выше 1 ГБ ФС не писала ничего. Чтобы можно было хранить там криптоконтейнер.