Создать libblabla.so из libblabla.a

ar x ../lib/LINUX_so/libcblas.a
ar cr ../lib/LINUX_so/liblapack_atlas.a *.o

cd ..
ld -shared -rpath /usr/lib -o lib/LINUX_so/liblapack_atlas.so \
--whole-archive lib/LINUX_so/liblapack_atlas.a

На многих архитектурах это сделать невозможно, т. к. в разделяемых библиотеках должен быть PIC.

>>в разделяемых библиотеках должен быть PIC.

Ага, действительно.
Посмотрел скрипт сборки ATLAS-а, там действительно в начале правят Makefile sed-ом, подставляя туда опции -fPIC в CCFLAGS и F77FLAGS.

Что такое PIC?

position-independent code