Подскажите, как включить X86_64 в конфиге ядра

если у тебя он 32битный, то никакой опцией не соберёшь.
сначала binutils
потом cross-gcc
glibc
cross-gcc-final
kernel
busybox
X
xfce

инструкции на сайте LFS. всё подробно описано.
собрать очень сложно. я для интереса начал собирать. дошёл до иксов. он даже заработал на ноуте с турионом-64. потом времени не стало, а потом заказал убунту 7.04 64битную. а каталог со сборкой так и лежит. пригодится потом ещё. :)

проще поставить 64битный дистр.