странный cron

Какой именно лог имеется в виду?

Настрой правильно почту, в crontab'e укажи e-mail куда отправлять отчеты о работе cron'a. Cron умеет отправлять по почте все что попадает в STDOUT и STDERR при выполнении скриптов.

Одна из самых частых проблем с такими симптомами — пути. Попробуй указать полные пути ко всем файлам, которые используются в скрипте — это раз. И полный путь к скрипту в файле crontab.

the_one, спасибо, похоже так и есть, пути не прописаны

o2inhal, по поводу почты где то видел, не обращал внимания, кстати мне постоянно пишется: "You have new mail in" я помню что это как то можно прочитать а как не помню, не подскажите случаем?

alexru, имелся ввиду мой лог(лог моего скрипта), получал его примерно так:
RES=`someaction`
echo "$RES" > /var/log/logfile

>по поводу почты где то видел, не обращал внимания, кстати мне постоянно пишется: "You have new mail in" я помню что это как то можно прочитать а как не помню, не подскажите случаем?

Почта эта собирается в mbox'e в /var/mail/$username или /var/spool/mail/$username, почитать ее можно так: mail -f /var/mail/$username, mutt тоже умеет читать из таких ящиков, некоторые почтовики, например Sylpheed, имеют нужный инструмент.

Ну дело в том что когда ты руками запускаешь у тебя переменные окружения чуточку не те с которыми крон запускает. Надо выяснить какая именно переменная окружения требуется.