Между М2007 и М2009 большие отличия, поэтому проще переустановить полностью. А ещё лучше подождать до 16 апреля и установить М2009.1 с KDE 4.2, который должен быть менее глючным :)
А если говорить ещё точнее, то учитывая что рпм-пакеты содержат упакованные файлы, то для системы которая на винте занимает 3-4 гига действительно потребуется скачивать 1-2, не больше.