Где находится ~/.xinitrc?

В /home/anonymous/.xinitrc :)

Знак '~' обозначает твой домашний каталог. Соответственно, это файл в твоем домашнем каталоге. Читай описание по своему shell'у : man bash

".xinitrc" находится в директории "~/". А вот "~/.xinitrc" ... Ну в корне тогда, наверное :))

Можно завернуть еще красивше и сказать, что ~/.xinitrc везде :)