Компиляция ядра

Да, надо =) Желательно 2.6 ставить, т.к. ht там будет намного лучше.

На самом деле это зависит от запускаемого софта. Т.е. в большинстве случаев вашему софту просто по барабану, сколько у вас физических|логических процессоров. Иногда же влючение HT может даже серьезно замедлить процессор. Почитайте по теме статьи на iXbt, opennet, и т.д. Поищите на русских сайтах через гугль.