mv?

можно тупо всё переписать, а потом также тупо удалить ненужное.

cd /start_point
find b/ -name '*.flac' -print | cpio -pdumv flac/

А вот как теперь удалить? Файлы с пробелами

Эм. Строим список find -iname «*crap*». Для каждого элемента делаем что-то типа:
NEW_NAME=«${DESTDIR}`echo »${OLD_NAME}" | sed откусить лишнее`"
mkdir -p «`dirname »${NEW_NAME}«`»
mv «${OLD_NAME}» «${NEW_NAME}»

find b/ -name '*.flac' -print | cpio -pdumv flac/

find b/ -name '*.flac' | while read OLD_NAME ; do
  Тут код, переносящий ${OLD_NAME} в новое место
done

файлы с пробелами

read читает построчно, подстановку переменных везде можно взять в кавычки - какие проблемы?

> read читает построчно, подстановку переменных везде можно взять в кавычки - какие проблемы?

А просто
find . -print0 | xargs -0 mv
не подойдет?

cd /source; find -iname «*crap*» -print0 | xargs -0 tar c --remove-files | tar x -C /dest