Debian packages: libjpeg-turbo и libjpeg62

Проблему бы решили versioned Provides, но жаль, их нет. Если они (библиотеки) ABI-совместимы — можно пересобрать под именем libjpeg62, да. Если нет — придётся пересобрать весь софт, который требует libjpeg.

Других вариантов я, навскидку, не вижу.

Никак же. Переделывай пакеты для программ и пиши в зависимостях.

В gentoo по умолчанию идет libjpeg-turbo, у меня по крайней мере.

ну в генте я сделал ничего не содержащий пакет, требующий libjpeg-turbo
итого - и зависимости на месте и либа нужная есть

задача заменить libjpeg62 или использовать их вместе?

Задача заменить libjpeg62 и положить пакет в репозиторий, причем libjpeg-turbo должен использоваться только на определенных серверах.

Сейчас склоняюсь к варианту включения libjpeg-turbo в пакет с прикладным ПО.

хм...так есть вариант иметь обе либы:
просто софт, интенсивно работающий с jpeg, запускать с турболибой
тогда с пакетами вообще никаких проблем
//хотя , видимо, это будет дольше

Пакеты содержать файлы с одинаковыми именами. Придется переименовывать.

нет
можно поставить в другую диру

Так libjpeg и так в 3х разных пакетах лежат, по версиям (libjpeg62, libjpeg7, libjpeg8).