>Удалил, но модуль все-равно подгружает networkmanager.
В lsmod виден r8169
Что-то я не понял, а как это модуль грузится и виден в /proc/modules, если файла /lib/modules/*/kernel/drivers/net/r8169.ko нет? Точно перезагрузился после этого?
А вообще не надо было так брать и удалять файл. Ядро же из пакета было установлено, теперь получился битый установленный пакет. Надо было ядро пересобрать без этого модуля или разобраться, почему не работает blacklist, а не делать поспешные действия.
С ядром ничего не сделала. Она обновила initrd (образ рамдиска, который грузится вместе с ядром и содержит самые нужные модули). Это всё есть в гугле, причём и на русском языке.