заменить совпадения в файле,все кроме тех которые находятся в "

Что-то мне подсказывает, что тебе для этого нужны регулярки…

На bash - не знаю, но не проще ли это сделать на C++?

Это просто маленькая часть скрипта по переливки данных из одной БД в другую написанную на bash,хотелось бы просто уже доделать на bash,что бы все запускалось 1ним файлом

Проще всего это сделать, естественно, на sed:

$ echo "325456,132,32,,,,,,'текст','текст,,текст,текст,текст,,'" | sed ":a;s/^\(\([^']*\('[^']*'\)*\)*\),,/\1@@/;ta"
325456,132,32@@@@@@'текст','текст,,текст,текст,текст,,'

немного неправильно прочитал условие, исправляю:

$ echo "325456,132,32,,,,,,'текст','текст,,текст,текст,текст,,'" | sed ":a;s/^\(\([^']*\('[^']*'\)*\)*\),,/\1,@@,/;ta"
325456,132,32,@@,@@,@@,@@,@@,'текст','текст,,текст,текст,текст,,'

Это ж csv, не знаю как с ним в баше, но для любого языка наверняка есть либы для его парсинга.

А вообще что-то мне подсказывает что можно конвертить либо без цсв вообще, либо в той БД в которую это всё льётся задать @@ значением по умолчанию для пустых полей.

Спасибо работает,щас добавил его в скрипт и буду тестить на больших файлах!Понял что надо sed углубленно изучать,еще раз спасибо

Понимаете проблема в том что я с Sybasе IQ знаком 3ю неделю,а у нее есть маленькие нюансы,та и еще то ли сервер криво настроен то ли я,но дело в том что я устанавливал разделители,и другие опции а оно их как бы игнорировало,а человек который занимается этим долгое время, помочь не смог,проблема аналогичная была и у него,всем спасибо за советы

Но лучше, действительно, использовать какие-то специализированные решения для парсинга csv-файлов. Хотя бы python и его модули.

Потому что текст же может содержать экранированные кавычки или что-то подобное? sed с этим уже не справится.

канонично пишется «проще на сях накатать»
посаны советуют ассемблер

С использованием (f)lex можно и на сях, пожалуй.