fuse+fstab

Ну если принцип такой же как при монтировании ntfs, то достаточно скопировать строчку из mtab (при смонтированной папке) в fstab, ну и подправить опции, если требуется.

Не такой-же, в encfs еще пароль требуется вводить.

А в качестве опции его не передать? Оно, правда, не очень секурно...

http://www.xakep.ru/post/57588/?print=true
Тут скрипт есть, который после запуска попросит пароль и смонтирует , ну а если надо чтоб и пароль сам вводился, то можно expect использовать .

Да зачем скрипт? Можно и echo pass|encfs -S /fold /fold пропистаь куда-нибудь, но это костыли все.

encfs по-моему не умеет. а вот ecryptfs + pam_ecryptfs умеет. можно даже к dm прикрутить. к slim например