Что это за команды?

sed -i '/skip-bdb/d' /etc/my.cnf

Удалить skip-bdb из /etc/my.cnf

mysql_upgrade -uadmin -p`cat /etc/psa/.psa.shadow`

Выполнить mysql_upgrade, пользователь admin, пароль из /etc/psa/.psa.shadow.

Погуглить религия не позволила? Простейшие же команды.

А в последней команде кавычки наклонные ` так и должны быть?

Да.

Погуглил сначала но не нашел ответ(

И еще позвольте спросить: лог обновления написал: warning: /etc/my.cnf created as /etc/my.cnf.rpmnew

Новый my.cnf создан в /etc/my.cnf а rpmnew бэкап старого или новый my.cnf записан в /etc/my.cnf.rpmnew ?

google://rpmnew - http://serverfault.com/questions/48776/why-do-i-have-rpmnew-file-after-an-update

Это новый конфиг.