Раздел внутри расширенного раздела.

Руками через fdisk - да. Удалить раздел, удалить расширенный и создать с теми же координатами.

Раздел заполнен.

Это ни на что не влияет. Удаление раздела - это удаление записей о его координатах в таблице в начале диска. Сами данные хранятся в середине и никуда не изчезают.

На всякий случай забекапьте первые 512 байт жёсткого диска (та самая таблица + загрузочный сектор) и обзаведитесь копией testdisk (программа может найти разделы на диске и создать таблицу сама).

Бэкапить надо не только перый сектор диска, но и первый сектор расширенного раздела.

А если в нём находится более одного логического — то всю цепочку секторов, разбросанную по всему диску.

Судя по скриншоту, там только один раздел.